Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Taf6Q62311 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms