Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spock1Q62288 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms