Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sptbn1Q62261 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sptbn1Q62261 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms