Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox19Q62249 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox19Q62249 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox19Q62249 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sox19Q62249 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox19Q62249 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms