Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SnrpcQ62241 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SnrpcQ62241 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SnrpcQ62241 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SnrpcQ62241 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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SnrpcQ62241 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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SnrpcQ62241 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SnrpcQ62241 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SnrpcQ62241 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SnrpcQ62241 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SnrpcQ62241 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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