Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Kdm5dQ62240 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm5dQ62240 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Kdm5dQ62240 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms