Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prkd1Q62101 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms