Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PtafrQ62035 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PtafrQ62035 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms