Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifi47Q61635 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifi47Q61635 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms