Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccne1Q61457 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccne1Q61457 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccne1Q61457 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 408.2 ms