Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pde3bQ61409 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pde3bQ61409 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms