Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf4bQ61136 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf4bQ61136 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms