Protein–RNA interactions for Protein: Q61103

Dpf2, Zinc finger protein ubi-d4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf2Q61103 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dpf2Q61103 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dpf2Q61103 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms