Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Meis1Q60954 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms