Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Cep250Q60952 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep250Q60952 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Cep250Q60952 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Cep250Q60952 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Cep250Q60952 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Cep250Q60952 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms