Protein–RNA interactions for Protein: Q60870

Reep5, Receptor expression-enhancing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep5Q60870 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep5Q60870 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep5Q60870 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep5Q60870 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep5Q60870 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep5Q60870 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep5Q60870 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep5Q60870 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep5Q60870 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep5Q60870 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep5Q60870 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Reep5Q60870 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Reep5Q60870 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms