Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Neurod1Q60867 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Neurod1Q60867 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Neurod1Q60867 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms