Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sik1Q60670 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sik1Q60670 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms