Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms