Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tdrd5Q5VCS6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms