Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med13Q5SWW4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med13Q5SWW4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms