Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bbs12Q5SUD9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bbs12Q5SUD9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbs12Q5SUD9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbs12Q5SUD9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbs12Q5SUD9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbs12Q5SUD9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbs12Q5SUD9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbs12Q5SUD9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbs12Q5SUD9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms