Protein–RNA interactions for Protein: Q5SU73

Coil, Coilin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoilQ5SU73 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CoilQ5SU73 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CoilQ5SU73 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CoilQ5SU73 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CoilQ5SU73 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms