Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sft2d1Q5SSN7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sft2d1Q5SSN7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms