Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TefmQ5SSK3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms