Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf12Q5SPL2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf12Q5SPL2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf12Q5SPL2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Phf12Q5SPL2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf12Q5SPL2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms