Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1F6

Trav5d-4, T cell receptor alpha variable 5D-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav5d-4Q5R1F6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav5d-4Q5R1F6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav5d-4Q5R1F6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms