Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm12253Q5NC48 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm12253Q5NC48 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm12253Q5NC48 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm12253Q5NC48 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm12253Q5NC48 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm12253Q5NC48 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm12253Q5NC48 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm12253Q5NC48 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm12253Q5NC48 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm12253Q5NC48 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm12253Q5NC48 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm12253Q5NC48 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm12253Q5NC48 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm12253Q5NC48 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm12253Q5NC48 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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