Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
1810065E05RikQ5NC41 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1810065E05RikQ5NC41 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms