Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdr39u1Q5M8N4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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