Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hs3st6Q5GFD5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hs3st6Q5GFD5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms