Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prkaa1Q5EG47 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prkaa1Q5EG47 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms