Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam208bQ5DTT3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam208bQ5DTT3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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