Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmtc2Q56A06 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmtc2Q56A06 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms