Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Spire1Q52KF3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Spire1Q52KF3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms