Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd28Q505D1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ankrd28Q505D1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms