Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Otol1Q4ZJM7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otol1Q4ZJM7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms