Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA45

Uncharacterized protein C11orf95 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4VA45 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q4VA45 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q4VA45 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q4VA45 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q4VA45 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q4VA45 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q4VA45 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q4VA45 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q4VA45 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q4VA45 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q4VA45 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q4VA45 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q4VA45 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q4VA45 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q4VA45 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q4VA45 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q4VA45 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q4VA45 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q4VA45 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q4VA45 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q4VA45 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q4VA45 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q4VA45 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q4VA45 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q4VA45 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q4VA45 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q4VA45 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q4VA45 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q4VA45 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q4VA45 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q4VA45 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q4VA45 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4VA45 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4VA45 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4VA45 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4VA45 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4VA45 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4VA45 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4VA45 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q4VA45 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4VA45 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4VA45 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4VA45 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4VA45 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4VA45 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q4VA45 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4VA45 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4VA45 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4VA45 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4VA45 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4VA45 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4VA45 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4VA45 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4VA45 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4VA45 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q4VA45 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4VA45 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4VA45 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4VA45 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4VA45 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4VA45 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4VA45 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4VA45 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4VA45 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q4VA45 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4VA45 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4VA45 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4VA45 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4VA45 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4VA45 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4VA45 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4VA45 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4VA45 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4VA45 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4VA45 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4VA45 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4VA45 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q4VA45 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4VA45 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4VA45 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4VA45 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4VA45 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4VA45 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4VA45 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q4VA45 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms