Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc3lQ4KL14 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc3lQ4KL14 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms