Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Shank3Q4ACU6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Shank3Q4ACU6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms