Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Brinp3Q499E0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brinp3Q499E0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms