Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5935Q497S0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5935Q497S0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5935Q497S0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5935Q497S0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5935Q497S0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5935Q497S0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5935Q497S0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5935Q497S0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5935Q497S0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5935Q497S0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm5935Q497S0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5935Q497S0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5935Q497S0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5935Q497S0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5935Q497S0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms