Protein–RNA interactions for Protein: Q497M0

Samt2, Predicted gene, EG434881, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt2Q497M0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Samt2Q497M0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms