Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
H2al1nQ497L1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms