Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Fam220aQ3ZN08 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Fam220aQ3ZN08 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam220aQ3ZN08 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Fam220aQ3ZN08 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Fam220aQ3ZN08 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Fam220aQ3ZN08 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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Fam220aQ3ZN08 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Fam220aQ3ZN08 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Fam220aQ3ZN08 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Fam220aQ3ZN08 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Fam220aQ3ZN08 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam220aQ3ZN08 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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