Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430531B16RikQ3V2J1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430531B16RikQ3V2J1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms