Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UZV7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q3UZV7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3UZV7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q3UZV7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3UZV7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3UZV7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms