Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc160Q3UYG1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc160Q3UYG1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms