Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc42bpaQ3UU96 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc42bpaQ3UU96 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdc42bpaQ3UU96 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms