Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trat1Q3UU67 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trat1Q3UU67 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms